March 20, 2018
Ο Δρ Χριστόφορος Νικολάου, Τμήμα Βιολογίας, Πανεπιστήμιο Κρήτης θα πραγματοποιήσει ομιλία με τίτλο Αόρατες Πόλεις. Δομή της χρωματίνης και γονιδιωματική αρχιτεκτονική σε ευκαρυωτικά γονιδιώματα, την Παρασκευή 30/3.
Περίληψη
H κατανομή των γονιδίων στα ευκαρυωτικά γονιδιώματα, τόσο σε μία όσο και σε τρεις διαστάσεις, δεν είναι τυχαία. Σε όλους τους ευκαρυώτες, οι σχετικές θέσεις των γονιδίων υπόκεινται σε πολλαπλούς περιορισμούς που σχετίζονται με τη δομή της χρωματίνης και την ανάγκη σύνθετης μεταγραφικής ρύθμισης. Στη συγκεκριμένη ομιλία θα παρουσίασουμε πώς μέσα από μια συγκριτική ανάλυση των δύο αυτών παραγόντων αναδύεται μια γενική λειτουργική διαμερισματοποίηση των γονιδίων στο γονιδίωμα του Σακχαρομήκυτα (S. cerevisiae). Σύμφωνα με αυτήν, τα συντηρημένα γονίδια βασικών λειτουργιών εντοπίζονται χωροταξικά κυρίως στο κέντρο του πυρήνα, ενώ τα γονίδια που εμπλέκονται σε δευτερεύουσες λειτουργίες τείνουν να καταλαμβάνουν την περιφέρεια. Στη συνέχεια θα δείξουμε πώς στο ίδιο γονιδίωμα, είναι εφικτός ένας διαχωρισμός γονιδίων σε δομικές περιοχές (γειτονιές) που φιλοξενούν γονίδια με κοινά λειτουργικά και εξελικτικά χαρακτηριστικά. Τα αποτελέσματα μας υποδεικνύουν μια δυναμική διαδικασία στην εξέλιξη της οργάνωσης του γονιδιώματος που προσομοιάζει τον διαχωρισμό (segregation) των σύγχρονων πόλεων σε ξεχωριστές γειτονιές.